آب پس از تامین و تصفیه، می‌بایست جهت استفاده در مخازنی ذخیره گردد. مخازن به چند منظور در سیستم‌های آبی استفاده می‌شوند. مهمترین آنها مخازن ذخیره‌ای آب می‌باشد که از احجام کوچک برای منازل، شهرک‌های کوچک، شهرک‌های صنعتی و روستاها تا مخازن بسیار بزرگ برای شهر‌های پرجمعیت متغیر می‌باشند. این مخازن عموما بصورت سرپوشیده در حجم‌های چند صد لیتری تا چند هزار مترمکعبی متغیر بوده و بنا به حجم و نوع استفاده در جنس‌های مختلف از پلی‌اتیلن، اف،آر،پی، فلزی، بتنی و . . . ساخته می‌شوند.  طراحی بهینه مخازن ذخیره‌ای روباز مانند مخازن پساب، آب کشاورزی یا صنعتی نیز در این زمره قرار خواهند گرفت. همچنین از مخازن برای تامین فشار بصورت هوایی نیز دراحجام کوچک‌تر استفاده می‌شود. طراحی معماری و سازه‌ای حوضچه‌ها و تانک‌ها زیر در این بخش انجام می‌گیرد. در طراحی مخازن، از تخصص‌های متنوعی از جمله هیدرولیک، سازه، ژئوتکنیک، مکانیکال و الکتریکال استفاده می‌شود.